El Programa de Maestría pretende formar profesionales que contribuyan a la Gestión Integrada de los Recursos Hídricos. El enfoque del Programa es la Investigación aplicada a la solución de los problemas hídricos de Centroamérica, particularmente en el área del Agua y la Gestión Integrada de los Recursos Hídricos en sus Cuencas Hidrográficas, enmarcándose en los siguientes objetivos:
- Formar profesionales capaces de contribuir activamente en los procesos de perfeccionamiento del manejo integrado y sostenible de la calidad de los recursos hídricos.
- Incrementar el nivel académico a profesionales dedicados a la investigación y la docencia a nivel de postgrado en el manejo de los Recursos Hídricos.
- Contribuir al desarrollo científico universal, mediante la investigación aplicada a problemas de los recursos hídricos de la región.