El Consejo del Centro para la Investigación en Recursos Acuáticos, UNAN-Managua/CIRA está conformado por los siguientes miembros:
- Directora
- Área de Investigación y Desarrollo
- Área de Docencia
- Área Analítica
- Área Técnica, Aseguramiento y Control de la Calidad
- Área de Proyección y Extensión
- Administrador
- Representante del ATD
- Representante del SITRA